Este anime é sobre a história de Makoto Naegi, que juntamente com mais quatorze estudantes, fazem parte de uma Academia Especial que é controlada por um urso de controlo remoto psicótico chamado Monokuma. A única hipotese que têm de sair da escola é matando um dos seus colegas e safar-se com isso. Se outra pessoa descobrir a identidade do assassino, o assassino será executado. No entanto se falharem, todos morrem menos o assassino. Quem será que se vai graduar desta escola?
Fonte: PortalTMZ